Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2J1Q9Y385 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms