Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED16Q9Y2X0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms