Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms