Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms