Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms