Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms