Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms