Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms