Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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