Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms