Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms