Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms