Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms