Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms