Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM8Q9BZR9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TRIM8Q9BZR9 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM8Q9BZR9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM8Q9BZR9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM8Q9BZR9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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