Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSDMCQ9BYG8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms