Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPERQ9BY12 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms