Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms