Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms