Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms