Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNAQ96QF7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms