Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00477Q96M19 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms