Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms