Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms