Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1572.5 ms