Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms