Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDAQ92838 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms