Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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