Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms