Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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