Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms