Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms