Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms