Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RASGEF1CQ8N431 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RASGEF1CQ8N431 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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