Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms