Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms