Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms