Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms