Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC93Q567U6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms