Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACSM3Q53FZ2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms