Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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RRN3P1Q2M238 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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RRN3P1Q2M238 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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RRN3P1Q2M238 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1Q2M238 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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