Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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