Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms