Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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E2F4Q16254 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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E2F4Q16254 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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E2F4Q16254 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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