Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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PTPRKQ15262 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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