Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms