Protein–RNA interactions for Protein: Q14657

LAGE3, EKC/KEOPS complex subunit LAGE3, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAGE3Q14657 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LAGE3Q14657 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LAGE3Q14657 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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LAGE3Q14657 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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LAGE3Q14657 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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LAGE3Q14657 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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LAGE3Q14657 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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LAGE3Q14657 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LAGE3Q14657 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LAGE3Q14657 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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