Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms