Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms