Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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ITGA7Q13683 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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